Awalnya, kegiatan mahasiswa Kristen difasilitasi oleh UKM Komunitas Mahasiswa Kristen Katolik (KMKK) untuk mahasiswa Kristen Protestan dan Katolik. Namun, meningkatnya jumlah mahasiswa Kristen Protestan dan Katolik mendorong pembentukan unit khusus.

Maka pada tahun 2020, KMK St. Thomas Aquinas ITERA didirikan sebagai rumah bagi ratusan mahasiswa Katolik yang menempuh pendidikan di ITERA. Berbagai kegiatan rohani dan sosial telah diadakan untuk membangun iman dan persaudaraan di antara anggotanya.

Nama St. Thomas Aquinas dipilih sebagai pelindung organisasi karena beliau dikenal sebagai seorang filsuf dan teolog yang menghargai ilmu pengetahuan dan iman, sesuai dengan semangat mahasiswa di institut teknologi.